因應新冠肺炎疫情嚴峻，執行署台南分署宣布，原則上該分署通知義務人、負責人或其他關係人到場報告，即日起至6月14日以前全部取消，相關人員均不需請假，如因案件急迫需要有到場必要時，也請遵循該分署的防疫措施。

台南分署呼籲，請台南鄉親遵守中央流行疫情指揮中心或台南市政府發布的各項防疫規定，台南分署將與臺南市政府衛生局保持密切聯繫，對於居家隔離期間趴趴走、不依規定配戴口罩等違反防疫規定之裁罰案件，將強力執行，以共同維護國民健康。

台南分署表示，該分署已實施到分署洽公實聯制措施，並要求民眾須全部配戴口罩，請洽民眾到該分署洽公時，攜帶國民身分證或健保卡以供核對身分。